MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus brevis KB290 plasmid pKB290-8 DNA

Total Repeats: 85

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020828	CAA	2	6	37	42	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020828	GCTAC	2	10	151	160	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_020828	GAGT	2	8	164	171	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020828	TTCA	2	8	235	242	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_020828	GCT	2	6	318	323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_020828	TTCC	2	8	353	360	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_020828	AATT	2	8	435	442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020828	CAAG	2	8	577	584	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_020828	TGT	2	6	635	640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020828	CTG	2	6	737	742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_020828	T	7	7	875	881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020828	AAAG	2	8	1002	1009	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020828	TGA	2	6	1023	1028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020828	TGCT	2	8	1031	1038	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_020828	A	6	6	1142	1147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020828	AAG	2	6	1151	1156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020828	ATT	2	6	1159	1164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020828	CTG	2	6	1201	1206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_020828	AT	4	8	1234	1241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020828	AACT	2	8	1325	1332	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_020828	T	6	6	1590	1595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020828	TGTTTT	2	12	1610	1621	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020828	GTG	2	6	1640	1645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020828	TTA	2	6	3401	3406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020828	GAA	2	6	3418	3423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020828	AAT	2	6	3494	3499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020828	AGCT	2	8	3520	3527	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_020828	TATT	2	8	3574	3581	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020828	GAC	2	6	4172	4177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_020828	AGC	2	6	4275	4280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_020828	AGT	2	6	4330	4335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020828	ATG	2	6	4355	4360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020828	GTCTT	2	10	4417	4426	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_020828	ATT	2	6	4477	4482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020828	TTGT	2	8	4493	4500	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020828	AATC	2	8	4513	4520	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_020828	TTCTAT	2	12	4576	4587	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_020828	A	6	6	4623	4628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020828	AAT	2	6	4748	4753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020828	ATG	2	6	4774	4779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020828	ACTATA	2	12	4824	4835	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_020828	TGC	2	6	4944	4949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_020828	AG	3	6	5422	5427	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020828	TAAA	3	12	5444	5455	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020828	CAAAC	2	10	5499	5508	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_020828	TAT	2	6	5562	5567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020828	CAA	2	6	5597	5602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_020828	T	6	6	6195	6200	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020828	ACCT	2	8	6224	6231	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_020828	AAC	2	6	6242	6247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_020828	CGC	2	6	6297	6302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_020828	T	6	6	6333	6338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020828	ATT	2	6	7372	7377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020828	CTT	2	6	7395	7400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_020828	AAAG	2	8	7438	7445	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020828	T	6	6	7496	7501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020828	TATTT	2	10	7520	7529	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020828	GCG	2	6	7535	7540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_020828	AAAG	2	8	7598	7605	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020828	TTAT	2	8	7669	7676	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020828	CCA	2	6	7685	7690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_020828	T	7	7	7697	7703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020828	TTC	2	6	7745	7750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_020828	G	6	6	7793	7798	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020828	TA	3	6	7881	7886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020828	CTT	2	6	7897	7902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_020828	TCA	2	6	7910	7915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_020828	AAT	2	6	7925	7930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020828	ATT	2	6	7943	7948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020828	TCT	2	6	7949	7954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_020828	TTC	2	6	7957	7962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_020828	TCA	2	6	7988	7993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_020828	TAA	2	6	8035	8040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020828	ACT	2	6	8062	8067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_020828	GAT	2	6	8076	8081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020828	AT	3	6	8226	8231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020828	TTGG	2	8	8335	8342	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020828	T	6	6	8347	8352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020828	ATC	2	6	8406	8411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_020828	GTT	2	6	8420	8425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020828	TAA	2	6	8426	8431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020828	AGC	2	6	8448	8453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_020828	TAA	2	6	8492	8497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020828	ATT	3	9	8520	8528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020828	CAAGT	2	10	8530	8539	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.